- «Я думаю, что радикализм неизбежен. Все мы становимся радикалами, когда понимаем, что необходимо как можно лучше изучить своего врага, чтобы одолеть его.»
- – Гидеон Рейвенор (Дэн Абнетт, «Инквизитор. Ордо Еретикус»).
Радикалы, между тем, отошли от имперских истин. Их верования широко разнятся, одни используют силы варпа против его обитателей, другие хотят расколоть тот самый Империум, которому они служат. Радикалы часто говорят, что все инквизиторы начинают в качестве пуритан, но, открывая для себя реалии Империума и остальной галактики, они неизбежно становятся всё более и более гибкими в своих убеждениях и, в конце концов, превращаются в радикалов. С другой стороны, пуритане считают, что самые крайние радикалы попросту поддались порче, и власть, которой они наделены, и ужасные тайны, что они познали, развратили их. Многие радикалы пытаются скрывать своё инакомыслие, находясь в компании других инквизиторов, предпочитая следовать своим замыслам в стороне от пуританских взоров. Другие же откровенны в своих взглядах и заработали себе много врагов, пытаясь привлечь пуритан на свою сторону. Инквизиторы обычно уделяют большое внимание тому, каких убеждений придерживаются их аколиты, по крайней мере, до тех пор, пока те не зарекомендуют себя, успешно завершив множество расследований.
Радикальных фракций слишком много, чтобы их можно было посчитать, но у некоторых из них множество приверженцев. Одна из самых распространенных — фракция ксанфитов, названная так в честь инквизитора Ксанфа, пойманного и убитого соратниками-инквизиторами за его убеждения. Он верил, что варп, и даже демоны, живущие в нем, могут быть укрощены и использованы на благо человечества. Ксанфиты изучают варп и Хаос, используют запрещённое колдовство, созданные демонами артефакты и даже подчиняют себе демонов. Знания — это излюбленное оружие ксанфитов и обращать оружие врага против него самого — их излюбленная тактика. Между тем, фракция истваанцев, берущая свое название от величайшего предательства Хоруса на Истваане III, убеждена, что благодаря войнам и катастрофам Империум становится сильнее. Истваанцы при любой возможности, пытаются вызвать восстания и катастрофы, ибо неразбериха и борьба являются их главными целями. Многие инквизиторы, расследуя жуткие угрозы Империуму, в конечном счете узнавали, что это дело рук истваанцев.