Префектура Магистериум — подразделение Адептус Механикус, фактически играющее роль тайной полиции. Основные задачи Префектуры — наблюдение за соблюдением догм Культа Механикус и преследование еретехов. В подчинении архимандритов миров-кузниц находятся как военные когорты Префектуры, так и одиночные охотники-убийцы.
Организации Империума
| ||
| Руководство | Высшие Лорды Терры | |
| Адептус Терра | Адептус Администратум • Адептус Астра Телепатика • Адептус Астрономика • Адептус Арбитрес • Адептус Кустодес • Департаменто Муниторум • Имперский Флот • Навис Нобилите • Официо Ассасинорум | |
| Адептус Министорум | Адепта Сороритас • Миссионария Галаксия • Священный Синод • Схола Прогениум | |
| Адептус Механикус | Духовенство • Ауксилия Мирмидон • Легио Кибернетика • Ордо Редуктор • Префектура Магистериум • Флот Адептус Механикус • Центурио Ординатус | |
| Инквизиция | Ордо Еретикус • Ордо Ксенос • Ордо Маллеус • Ордо Минорис | |
| Вооружённые силы | Адептус Астартес • Имперская Гвардия • Имперский Военный Флот • Коллегия Титаника • Сёстры Битвы • Силы Планетарной Обороны • Скитарии | |